AG-Treffen 2021/11/24: 3D am Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels: Unterschied zwischen den Versionen

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==Werkstattbericht==
 
==Werkstattbericht==
* Thomas Kaiser (Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels, Hamburg)
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Thomas Kaiser (Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels, Hamburg)
  
* Geschichte des Leibniz-Instituts
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'''Geschichte des Leibniz-Instituts''' <br>
 
* junges Institut
 
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* Schausammlung & wissenschaftliche Sammlung (10 Mio Objekte)
 
* Schausammlung & wissenschaftliche Sammlung (10 Mio Objekte)
  
* Sammlung Mammalogie
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'''Sammlung Mammalogie''' <br>
 
* Besonderes Interesse: Primaten
 
* Besonderes Interesse: Primaten
 
* Ziel: Fossilien in Zusammenhang mit Erkenntnissen zu Primaten zusammen bringen
 
* Ziel: Fossilien in Zusammenhang mit Erkenntnissen zu Primaten zusammen bringen
  
* (Scanning) Olduwai(schlucht)  
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'''(Scanning) Olduwai(schlucht)''' <br>
 
* 1,8 Millionen Jahre Menschheitsgeschichte
 
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* Fossilien aus der Schlucht sind im Nationalmuseum in Tansania (Universalmuseum)
 
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* OH9: Homo Erectus Schädel mit 1l Gehirnvolumen
* OH9
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* OH5: ist eingeschlossen, darf nicht geöffnet werden
* Homo Erectus Schädel mit 1l Gehirnvolumen
 
 
 
* OH5
 
* ist eingeschlossen, darf nicht geöffnet werden
 
 
* -> 3D Modell wird vom Modell gemacht, um weiter daran forschen zu können
 
* -> 3D Modell wird vom Modell gemacht, um weiter daran forschen zu können
  
* Holotypus -> Referenzobjekt
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'''Holotypus als Referenzobjekt''' <br>  
 
* Tansania ist reich an Holotypen
 
* Tansania ist reich an Holotypen
 
* LH4 (3,7 Millionen Jahre) -> Holotypus einer fossilen Menschenart -> muss konservatorisch geschützt werden
 
* LH4 (3,7 Millionen Jahre) -> Holotypus einer fossilen Menschenart -> muss konservatorisch geschützt werden
 
 
* OH7 (1,75 Millionen Jahre) -> Holotypus Homo habilis  
 
* OH7 (1,75 Millionen Jahre) -> Holotypus Homo habilis  
 
 
* Fossilien & Artefakte sind relevant für die Forschung
 
* Fossilien & Artefakte sind relevant für die Forschung
* Steinwerkzeuge bei Transport von Kenia nach Tansania beschädigt
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* Steinwerkzeuge wurden beim Transport von Kenia nach Tansania beschädigt
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* -> Transporte liefern Sub- und Objekte Gefahren aus
  
* Biomechanik am Kiefer
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'''Biomechanik am Kiefer''' <br>
 
* Digitalisierung von wertvollen Fossilien
 
* Digitalisierung von wertvollen Fossilien
* Verfahren: Photogrammetrie
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* '''Verfahren''': Photogrammetrie
* Ziel: Hohe Qualität, möglichst genaue Erfassung
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* '''Ziel''': Hohe Qualität, möglichst genaue Erfassung
 
 
* Autograph: um 1950
 
  
* Problematische Bedingungen für technische Ausrüstung
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'''Problematische Bedingungen für technische Ausrüstung''' <br>
* verschiedene Exxperimente
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* verschiedene Experimente wurden getestet, um trotz der Schwierigkeiten des eingeschränkten Equipment-Transports qualitativ hochwertige Erfassungen zu generieren:
* Drehteller, zwei Kameras gleichzeitig -> Effizienz
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* Drehteller, zwei Kameras gleichzeitig -> '''Effizienz'''
 
* 16 Fotos / Sekunde
 
* 16 Fotos / Sekunde
* Ringleuchten -> insbesondere das Licht von vorne ist relevant
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* Ringleuchten -> insbesondere das Licht von vorn ist relevant
 
* Targets & Colorchecker
 
* Targets & Colorchecker
 
* -> Equipment muss in einen Koffer passen -> Transport
 
* -> Equipment muss in einen Koffer passen -> Transport
 
* Makroobjektive, andere Objektive kommen nicht in Frage
 
* Makroobjektive, andere Objektive kommen nicht in Frage
  
* Beispiel (Metashape)
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'''Beispiel (Metashape)''' <br>
 
* 7000 Fotos für ein Objekt
 
* 7000 Fotos für ein Objekt
 
* 4677 Kameras
 
* 4677 Kameras
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* Spare Point Cloud: 1.2 Millionen Punkte
 
* Spare Point Cloud: 1.2 Millionen Punkte
  
* Geomagic
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'''Geomagic''' <br>
 
* Kraftfeedback
 
* Kraftfeedback
* (Pulver)Druck anschließend möglich
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* (Pulver-)Druck anschließend möglich
 
* Wasser in Gipsbett
 
* Wasser in Gipsbett
 
* -> Ziel: Gipsmodelle sollen originalfarbig Besucher:innen zur Verfügung stehen
 
* -> Ziel: Gipsmodelle sollen originalfarbig Besucher:innen zur Verfügung stehen
  
* Weiteres Ziel: Forschung
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'''Weiteres Ziel: Forschung''' <br>
* Finite-Elemente Modell nur nach Kaukräften
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* Beim Finite-Elemente Modell können Kaukräfte gemessen werden
* Modell nur nach Kräften gemessen
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** Digitalisate können Forschungsfragen dienen -> große Zähne -> Robustheit -> mögliche Schlussfolgerung: Folge von harter Nahrung (unsicher)
* Digitalisate können Forschungsfragen dienen -> große Zähne -> Robustheit -> mögliche Schlussfolgerung: Folge von harter Nahrung (unsicher)
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* Oberflächenmodell: zur Untersuchung dieser Frage
* Oberflächenmodell zur Untersuchung dieser Frage
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** Muskeln werden rekonstruiert, Kauen mit Nahrung wird simuliert -> es kann gezeigt werden, wo die Kräfte wirken
* Muskeln werden rekonstruiert, Kauen mit Nahrung wird simuliert -> es kann gezeigt werden, wo die Kräfte wirken
 
 
* -> Folgefrage wozu sind die Knochen angepasst, zu welcher Art Nahrung waren sie in der Lage (Untersuchung nur in 2D -> reicht das vielleicht aus?)
 
* -> Folgefrage wozu sind die Knochen angepasst, zu welcher Art Nahrung waren sie in der Lage (Untersuchung nur in 2D -> reicht das vielleicht aus?)
* Erkenntnis: OH5 Grasesser
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* Erkenntnis der Analyse durch (digitale) Modelle: OH5 ist ein Grasesser
  
* Projekt
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'''Projekt''' <br>
* Dar es Salaam
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* in Dar es Salaam: Kooperation von Hamburger und Tansanischen Institutionen
* Kooperation von Hamburger und Tansanischen Schulen
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* -> Gemeinsame Schulungen im Umgang mit den Sammlungsobjekten -> Förderung der kooperativen Arbeit
  
* Fazit
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'''Fazit''' <br>
 
* Orientierung der Forschungsansätze an dem, was sichtbar ist -> Oberflächendigitalisat
 
* Orientierung der Forschungsansätze an dem, was sichtbar ist -> Oberflächendigitalisat
* CT kann diese Qualität nicht garantieren, Volumendaten sind nicht immer notwendig
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* CT kann diese Qualität nicht garantieren, Volumendaten sind auch nicht immer notwendig
* stl. Datei -> forschungsrelevantes Format
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* STL Datei -> forschungsrelevantes Format
* Farbinformationen: Für morphologische Fragestellungen nicht (unbedingt)notwendigt
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* Farbinformationen: Für morphologische Fragestellungen nicht (unbedingt)notwendig
 
    
 
    
 
===Diskussion===
 
===Diskussion===

Version vom 26. Januar 2022, 11:03 Uhr


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  • Künftig: Mailingliste wird angelegt, näheres im nächsten Monat

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  • Berichte der sieben Task Areas
  • Helpdesk für Antragsphase / Anfänge etc. -> wird gut angenommen, ist hilfreich
  • -> Kontaktaufnahme bei Antragsstellung ist hilfreich, auch der Kontakt zur DFG ist hilfreich

i3mainz
Martin:

Werkstattbericht

Thomas Kaiser (Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels, Hamburg)

Geschichte des Leibniz-Instituts

  • junges Institut
  • Schausammlung & wissenschaftliche Sammlung (10 Mio Objekte)

Sammlung Mammalogie

  • Besonderes Interesse: Primaten
  • Ziel: Fossilien in Zusammenhang mit Erkenntnissen zu Primaten zusammen bringen

(Scanning) Olduwai(schlucht)

  • 1,8 Millionen Jahre Menschheitsgeschichte
  • Fossilien aus der Schlucht sind im Nationalmuseum in Tansania (Universalmuseum)
  • OH9: Homo Erectus Schädel mit 1l Gehirnvolumen
  • OH5: ist eingeschlossen, darf nicht geöffnet werden
  • -> 3D Modell wird vom Modell gemacht, um weiter daran forschen zu können

Holotypus als Referenzobjekt

  • Tansania ist reich an Holotypen
  • LH4 (3,7 Millionen Jahre) -> Holotypus einer fossilen Menschenart -> muss konservatorisch geschützt werden
  • OH7 (1,75 Millionen Jahre) -> Holotypus Homo habilis
  • Fossilien & Artefakte sind relevant für die Forschung
  • Steinwerkzeuge wurden beim Transport von Kenia nach Tansania beschädigt
  • -> Transporte liefern Sub- und Objekte Gefahren aus

Biomechanik am Kiefer

  • Digitalisierung von wertvollen Fossilien
  • Verfahren: Photogrammetrie
  • Ziel: Hohe Qualität, möglichst genaue Erfassung

Problematische Bedingungen für technische Ausrüstung

  • verschiedene Experimente wurden getestet, um trotz der Schwierigkeiten des eingeschränkten Equipment-Transports qualitativ hochwertige Erfassungen zu generieren:
  • Drehteller, zwei Kameras gleichzeitig -> Effizienz
  • 16 Fotos / Sekunde
  • Ringleuchten -> insbesondere das Licht von vorn ist relevant
  • Targets & Colorchecker
  • -> Equipment muss in einen Koffer passen -> Transport
  • Makroobjektive, andere Objektive kommen nicht in Frage

Beispiel (Metashape)

  • 7000 Fotos für ein Objekt
  • 4677 Kameras
  • Fotos: Alle Winkel: 1,5°
  • Targets werden an Maßstäben rekonstruiert
  • Vorgehensweise Dense Point Cloud -> von Ankerpunkten ausgehen
  • Spare Point Cloud: 1.2 Millionen Punkte

Geomagic

  • Kraftfeedback
  • (Pulver-)Druck anschließend möglich
  • Wasser in Gipsbett
  • -> Ziel: Gipsmodelle sollen originalfarbig Besucher:innen zur Verfügung stehen

Weiteres Ziel: Forschung

  • Beim Finite-Elemente Modell können Kaukräfte gemessen werden
    • Digitalisate können Forschungsfragen dienen -> große Zähne -> Robustheit -> mögliche Schlussfolgerung: Folge von harter Nahrung (unsicher)
  • Oberflächenmodell: zur Untersuchung dieser Frage
    • Muskeln werden rekonstruiert, Kauen mit Nahrung wird simuliert -> es kann gezeigt werden, wo die Kräfte wirken
  • -> Folgefrage wozu sind die Knochen angepasst, zu welcher Art Nahrung waren sie in der Lage (Untersuchung nur in 2D -> reicht das vielleicht aus?)
  • Erkenntnis der Analyse durch (digitale) Modelle: OH5 ist ein Grasesser

Projekt

  • in Dar es Salaam: Kooperation von Hamburger und Tansanischen Institutionen
  • -> Gemeinsame Schulungen im Umgang mit den Sammlungsobjekten -> Förderung der kooperativen Arbeit

Fazit

  • Orientierung der Forschungsansätze an dem, was sichtbar ist -> Oberflächendigitalisat
  • CT kann diese Qualität nicht garantieren, Volumendaten sind auch nicht immer notwendig
  • STL Datei -> forschungsrelevantes Format
  • Farbinformationen: Für morphologische Fragestellungen nicht (unbedingt)notwendig

Diskussion

Robert

  • Setup: Winkel 1,5 ° – warum?
  • Thomas: Grund: schnellste Speichermedien -> Zeit der Verarbeitung des Fotos -> möglichst gute Bilder werden benötigt
  • -> Schluss lieber mehr JPEGs als wenige TIFFs (ohne Komprimierung dauert es zu lange)
  • -> Möglichkeit vieler genauer Bilder
  • -> Effizienz ist der Hauptfaktor
  • -> Rechenkapazität ist problematischer als die Aufnahme
  • Nahaufnahmen -> nicht zu nah, mittlere Brennweite, da sonst Tiefenschärfe nicht ausreicht
  • -> Automatisierung druch Scripte für Effizienz auch notwendig


Armin

  • Relevanz der Qualität des Bildes
  • Markerpunkte von Metashape – Erfahrungen, welche Marker waren es in der Abbildung?
  • Thomas: Zwei Arten von Markern:
    • Coded Targets (Maßstäbe Metashape)
    • -> gute Erfahrungen mit hichwertigem Ausdruck auf Fotopapier
  • Etafoam guter Hintergrund auch zur Referenzierung
  • 2. Möglichkeit:
    • Targets direkt auf Objekt kleben
    • -> Standards sind notwendig, um eine gewisse Qualitäts"einheit" zu generieren
    • -> nicht kommerzielle Nutzung sollte gesichert werden


Robert

  • Setup: Winkel 1,5 ° – warum?
  • Thomas: Grund: schnellste Speichermedien -> Zeit der Verarbeitung des Fotos -> möglichst gute Bilder werden benötigt
    • -> Schluss lieber mehr JPEGs als wenige TIFFs (ohne Komprimierung dauert es zu lange)
    • -> Möglichkeit vieler genauer Bilder
    • -> Effizienz ist der Hauptfaktor
    • -> Rechenkapazität ist problematischer als die Aufnahme
    • Nahaufnahmen -> nicht zu nah, mittlere Brennweite, da sonst Tiefenschärfe nicht ausreicht
    • -> Automatisierung druch Scripte für Effizienz auch notwendig


Armin

  • Relevanz der Qualität des Bildes
  • Markerpunkte von Metashape – Erfahrungen, welche Marker waren es in der Abbildung?
  • Thomas: Zwei Arten von Markern:
    • Coded Targets (Maßstäbe Metashape)
    • -> gute Erfahrungen mit hichwertigem Ausdruck auf Fotopapier
  • Etafoam guter Hintergrund auch zur Referenzierung
  • 2. Möglichkeit:
    • Targets direkt auf Objekt kleben
    • -> Standards sind notwendig, um eine gewisse Qualitäts"einheit" zu generieren
    • -> nicht kommerzielle Nutzung sollte gesichert werden

Sonstiges

Tassenprojekt

  • https://ag3d.org/index.php/Tassenbenchmark
  • Link zum Hochladen ist in der Einladungsmail, ansonsten gern auf Anfrage
  • Metadaten sind wichtig
  • Angaben zum Setup
  • Angaben zur Software
  • Perspektive: Digitaler Tassenschrank bei Kompakkt


Maria

  • Digitales Objekt Deutsches Museum
  • AG3D als Best Practice Beispiel


Martin

  • Für das kommende Jahr sind noch Werkstattberichte offen


Maren

  • Projekt läuft in März aus - Abschlussbericht zum Projekt?
  • -> März (30.03.)


Mareike

  • Virtuelles Museum Puppets 4.0
  • 19.01. (Frank Bauer?)
  • 23.02. Mareike
  • 30.03. Maren