AG-Treffen 2021/07/14: Anthroworks3D: Unterschied zwischen den Versionen
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* Marleen: Physische Messung wurde genutzt, um Skalierungsproblemen vorzubeugen, keine Kalibrierung wurde gemacht | * Marleen: Physische Messung wurde genutzt, um Skalierungsproblemen vorzubeugen, keine Kalibrierung wurde gemacht | ||
− | Physische Messungen werden nicht ersetzt werden können, digitale Messungen sind eher als Zusatz zu verstehen, um auch im Nachgang weiter an dem Objekt zu arbeiten | + | **Physische Messungen werden nicht ersetzt werden können, digitale Messungen sind eher als Zusatz zu verstehen, um auch im Nachgang weiter an dem Objekt zu arbeiten |
− | * Beispiel: Forensik: Stichwunde wird im 2D Bild nicht gezeigt, 3D kann besser dreidimensionale Relationen deutlich machen | + | **Beispiel: Forensik: Stichwunde wird im 2D Bild nicht gezeigt, 3D kann besser dreidimensionale Relationen deutlich machen |
* Patrick: Annotationen, wo werden diese gespeichert und wie? | * Patrick: Annotationen, wo werden diese gespeichert und wie? | ||
* Marleen: Nutzen JSON Format, um die Annotationen & Metadaten abzuspeichern | * Marleen: Nutzen JSON Format, um die Annotationen & Metadaten abzuspeichern | ||
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* Marleen: Modelle dürfen wir nicht weitergeben. Sammlung gehört Göttingen. Austausch ist möglich, aber nicht alles kann weitergegeben werden. | * Marleen: Modelle dürfen wir nicht weitergeben. Sammlung gehört Göttingen. Austausch ist möglich, aber nicht alles kann weitergegeben werden. | ||
− | Verweis auf Rechtsmedizin -> Zugriffsrechte | + | **Verweis auf Rechtsmedizin -> Zugriffsrechte |
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* Zoe: Polygonreduktion automatisiert über Blender | * Zoe: Polygonreduktion automatisiert über Blender | ||
− | Annotationen möglich (wie in einem GoogleDoc) | + | **Annotationen bei Kompakkt möglich (wie in einem GoogleDoc) |
− | Basiert das Datenmodell auf Standards? | + | **Basiert das Datenmodell auf Standards? |
* Marleen: Datenmodell wurde selbst ausgelotet, in stetiger Absprache mit der Anthropologie (Hinsichtlich einer Ontologie) | * Marleen: Datenmodell wurde selbst ausgelotet, in stetiger Absprache mit der Anthropologie (Hinsichtlich einer Ontologie) | ||
* Zoe: NFDI4Culture: Standards entwickeln für Annotationsformate | * Zoe: NFDI4Culture: Standards entwickeln für Annotationsformate | ||
− | mit vorhandenen Formaten arbeiten, das Rad nicht neu erfinden | + | **mit vorhandenen Formaten arbeiten, das Rad nicht neu erfinden |
− | UX: Unterschiede je nach Zielgruppe | + | **UX: Unterschiede je nach Zielgruppe |
− | sieht großes Potenzial hinsichtlich NFDI4Culture (Vernetzung) | + | **sieht großes Potenzial hinsichtlich NFDI4Culture (Vernetzung) |
+ | * Maria: Taskforce Zoe & Marleen zu Annotationsstandards? | ||
− | * Maria: | + | * Anmerkung von Maria zur Präsentation: Bei Gyrolog wurde auch mit Knete gearbeitet, um Realteile zu fixieren, Improvisation gehört dazu |
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− | Gibt es auch andere Formate als OBJ in dem Bereich? | + | *Maria: Gibt es einen globalen Austausch? |
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* Marleen: Austauschformat: Serialisierung bei JSON | * Marleen: Austauschformat: Serialisierung bei JSON | ||
− | Modelle: OBJ und PNG | + | **Modelle: OBJ und PNG |
− | Aktuell ist es lokal, die mitgegeben werden kann, Austauschformat kann dann geschickt werden (kleine Austauschbarkeit) | + | **Aktuell ist es lokal, die mitgegeben werden kann, Austauschformat kann dann geschickt werden (kleine Austauschbarkeit) |
− | Datenbank ist in Entwicklung, weitere Entwicklung steht bevor | + | **Datenbank ist in Entwicklung, weitere Entwicklung steht bevor |
− | Wichtiger Punkt: Rechtevergabe | + | **Wichtiger Punkt: Rechtevergabe |
− | Automatisierung: Aktuell Teilautomatisierung: | + | **Automatisierung: Aktuell Teilautomatisierung: |
− | Bilder werden in einen Bereich geschoben, Pipeline wird dadurch ausgelöst | + | **Bilder werden in einen Bereich geschoben, Pipeline wird dadurch ausgelöst |
− | Meshroom läuft diese Pipeline durch | + | **Meshroom läuft diese Pipeline durch |
− | Ziel ist: Knochen muss nicht mehr speziell ausgerichtet werden | + | **Ziel ist: Knochen muss nicht mehr speziell ausgerichtet werden |
− | Priorität aktuell: Informationssystem | + | **Priorität aktuell: Informationssystem |
* Maria: Ideen zur Automatisierung? | * Maria: Ideen zur Automatisierung? | ||
− | * Marleen: Andere Bilder (Beispielsweise Fliegen oder Sofas) werden bereits mit KI automatisch annotiert | + | * Marleen: Andere Bilder (Beispielsweise Fliegen oder Sofas) werden bereits mit KI automatisch annotiert, wäre auch eine Möglichkeit für die Anwendung |
− | wäre auch eine Möglichkeit für die Anwendung | ||
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* Robert: Ist die Meshroom Pipeline exportierbar? | * Robert: Ist die Meshroom Pipeline exportierbar? | ||
* Marleen: Ja | * Marleen: Ja | ||
− | * Marleen bietet an bei technischen Fragen auch Studierende mit in | + | * Marleen bietet an bei technischen Fragen auch Studierende mit in eine Sitzung einzuladen. |
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==Offene Runde== | ==Offene Runde== |
Version vom 27. Juli 2021, 12:16 Uhr
Werkstattbericht Marleen Mohaupt (Anthroworks3D)
Probleme der Skelettuntersuchung
- Transport, Analyse -> viel Bewegung -> Beschädigungen können auftreten
- Sammlungen stehen nicht dauerhaft zur verfügung, sondern werden teils wieder beigesetzt -> Erhaltung
- -> Anstöße zur Entwicklung des Prototypen einer Photogrammetrie-Pipeline
Kooperationen mit verschiedenen Hochschulsammlungen
- Göttingen: Rödelheim Skeletal Collection
- interessant insbesondere wegen des Alters
- sollten 2020 beigesetzt werden
- Frage nach Digitalisierung für Erhalt kam auf
- Untersuchungen zu den Skeletten laufen noch
- Mittweida: Aufgabe: Digitalisieren & nutzbar machen
- d.h.: Annotieren, Messen, Austauschen
- Prototyp soll zurück nach Göttingen, um Untersuchungen am digitalen 3D Objekt durchzuführen
Lösungskonzept
- Digitalisierung -> Modell wird erstellt -> daran kann/soll weiter geforscht werden
- Realvermessungen finden auch statt und sollen künftig auch integriert werden
- bestehende & laufende Untersuchungen sollen integriert werden
Fach- und Forschungsstand
- Photogrammetriemodelle können für einen wissenschaftlichen Anspruch erstellt werden
- 3D4Medical -> Blick in den Menschen -> Erlebbar machen
- Frage: Wie kann man die beiden verknüpfen?
- Digitalisierung auf einem hohen Niveau, um Untersuchungen für die wissenschaft zu ermöglichen
Ziele
- 3D-Echtzeitrendering (Methoden aus dem Game Development)
- Kooperation mit der Medieninformatik
- In dieser Zusammenarbeit entstand der Prototyp
- Kosteneffizienz: Bestehende Soft- / Hardware nutzen, Softboxen mussten gekauft werden
- Austauschbarkeit: Auch interdisziplinär, andere Objekte sollen ebenfalls davon Nutzen tragen
- Qualität: wissenschaftliche Nutzung / Auswertung
- UX / UI: breite Nutzbarkeit
- Untersuchungen: Sollen mit physischen Untersuchungen mithalten können
Pipeline
- Fundstück - Fotografien - 3D-Modell - Modell Optimierung
- Teilautomatisierung des Prozesses ist bereits erreicht, Ziel ist eine Komplettautomatisierung
- Dauer 8 Min
Aufnahme
- Drehteller
- 3 Kameras
- 2 Softboxen
- Spezielle Glastische mit entspiegeltem Glas (Knochen kann so auch von unten aufgenommen werden
Nutzung von Referenz mit CCTags
- mehrere Objekte können gleichzeitig Digitalisiert werden / im Zusammenhang digitalisiert werden
- 0.045 mm Abweichung von physischen Messungen
Meshroom
- Pipeline kann selbst zusammengestellt werden
- Pipeline kann für alle Knochen gleich ablaufen
Meshlab
- Retopology
- Notwendigkeit der Vergleiche von Modellen
- -> Polygone müssen angepasst werden je nach Nutzen
- -> für die Anthropologie nicht einsetzbar, weil Echtzeitvergleiche notwendig
- 50.000 Polygone für ein Modell festgelegt
- Abweichung 0.01%, es stehen allerdings noch weitere Tests an
3D-Rekonstruktionsergebnisse
- zeigt den ersten digitalisierten Knochen (mit Knetresten eines Stabiliserungsversuchs)
- Pathologien werden mit dargestellt
Anwendung des Prototypen
- Nutzung von unity, programmiert in C#
[Zeigt Demonstrationsvideo der Anwendung]
Annotationen
- Punkte werden am Objekt gesetzt
- Linienmarkierung wird am Objekt, nicht im Raum gemacht, Fläche kann auch gezeigt werden, um bestimmte Teile des Objektes hervorzuheben
Messung
- Messungen geschehen von Punkt zu Punkt
- Können geändert und/oder Annotiert werden
- Umfangsmessungen sind möglich
- Winkelmessung
- Weitere Messverfahren sind in der Entwicklung
Evaluation
- Evaluationen von 7 Anthropolog:innen verschiedener Wissensstände
- Welche Unterschiede entstehen bei den Messungen? Wie ist die UX?
- Getestet mit Anthropolog:innen und Medieninformatik Studierenden
- Grafik: Man sollte im rechten Bereich sein
- Ergebnis: Der Prototyp kann eingesetzt werden
Messzuverlässigkeit
- Ersetzt die Arbeit am Realknochen nicht, dennoch gute Lösung
Schwierigkeiten
- Ausrichtung / Kameraposition
- Auflösung
- Fehlender Tastsinn
(...)
Anwendungsfelder
- dauerhafte Verfügbarkeit
- Bestandsschutz
- Messungen können schnell durchgeführt werden
- Vergleichspopulationen können international verglichen werden
- Austausch ist gegeben
Vision für die Zukunft
- Falldatenbank
- -> verschiedene Kurator:innen & Forschungsgruppen sollen das Tool nutzen
- -> Vernetzung / Austausch
- Integration von weiteren Daten (CT, Endoskopie)
- Integration von physischen Untersuchungen
Ausblick
- ForensicWorks3D
- zeigt Dose mit Abdrücken: Spuren können verglichen werden
- -> xWorks3D: Anwendung ist auf verschiedene Objekte anwendbar
Diskussion
Messung
- Patrick: Messungen am Realobjekt / Meinst du die Messung ist gut genug, um nur digital zu messen?
- Marleen: Physische Messung wurde genutzt, um Skalierungsproblemen vorzubeugen, keine Kalibrierung wurde gemacht
- Physische Messungen werden nicht ersetzt werden können, digitale Messungen sind eher als Zusatz zu verstehen, um auch im Nachgang weiter an dem Objekt zu arbeiten
- Beispiel: Forensik: Stichwunde wird im 2D Bild nicht gezeigt, 3D kann besser dreidimensionale Relationen deutlich machen
- Patrick: Annotationen, wo werden diese gespeichert und wie?
- Marleen: Nutzen JSON Format, um die Annotationen & Metadaten abzuspeichern
Weitergabe von Daten
- Zoe: Background: sie kommt aus zwei unterschiedlichen Kontexte, u.a. Uni Köln Kompakkt. Kann man mit den heute vorgestellten Daten arbeiten?
- Marleen: Modelle dürfen wir nicht weitergeben. Sammlung gehört Göttingen. Austausch ist möglich, aber nicht alles kann weitergegeben werden.
- Verweis auf Rechtsmedizin -> Zugriffsrechte
Polygonreduktion & Standards
- Zoe: Polygonreduktion automatisiert über Blender
- Annotationen bei Kompakkt möglich (wie in einem GoogleDoc)
- Basiert das Datenmodell auf Standards?
- Marleen: Datenmodell wurde selbst ausgelotet, in stetiger Absprache mit der Anthropologie (Hinsichtlich einer Ontologie)
- Zoe: NFDI4Culture: Standards entwickeln für Annotationsformate
- mit vorhandenen Formaten arbeiten, das Rad nicht neu erfinden
- UX: Unterschiede je nach Zielgruppe
- sieht großes Potenzial hinsichtlich NFDI4Culture (Vernetzung)
- Maria: Taskforce Zoe & Marleen zu Annotationsstandards?
- Anmerkung von Maria zur Präsentation: Bei Gyrolog wurde auch mit Knete gearbeitet, um Realteile zu fixieren, Improvisation gehört dazu
Nutzung & Austausch
- Maria: Gibt es einen globalen Austausch?
- Gibt es auch andere Formate als OBJ in dem Bereich?
- Marleen: Austauschformat: Serialisierung bei JSON
- Modelle: OBJ und PNG
- Aktuell ist es lokal, die mitgegeben werden kann, Austauschformat kann dann geschickt werden (kleine Austauschbarkeit)
- Datenbank ist in Entwicklung, weitere Entwicklung steht bevor
- Wichtiger Punkt: Rechtevergabe
- Automatisierung: Aktuell Teilautomatisierung:
- Bilder werden in einen Bereich geschoben, Pipeline wird dadurch ausgelöst
- Meshroom läuft diese Pipeline durch
- Ziel ist: Knochen muss nicht mehr speziell ausgerichtet werden
- Priorität aktuell: Informationssystem
- Maria: Ideen zur Automatisierung?
- Marleen: Andere Bilder (Beispielsweise Fliegen oder Sofas) werden bereits mit KI automatisch annotiert, wäre auch eine Möglichkeit für die Anwendung
Export der Pipeline
- Robert: Ist die Meshroom Pipeline exportierbar?
- Marleen: Ja
- Marleen bietet an bei technischen Fragen auch Studierende mit in eine Sitzung einzuladen.
Offene Runde
- Zoe: NFDI4Culture: Veranstaltungen an den Verteiler schicken?
- Robert: Gerne an den Verteiler.
- Maximilian: Finanzielle Themen: Vorschlag fürs Wiki: Welche Förderungen gibt es aktuell für Digitalisierungsprojekte?
- Martin: Machen wir gerne. Teilweise auch schon hier, aber weniger konkret auf Digitalisierung bezogen: https://wissenschaftliche-sammlungen.de/de/foerdermoeglichkeiten/
- Martin: Zwei Bereiche: Infrastruktur / Forschung
Automatisierung kann sehr hilfreich sein bei DFG Anträgen Viele 3D Projekte sind aktuell sehr fachspezifisch, daher nicht universell anwendbar Brückenantrag bei Projekten, die Infrastruktur und Forschung kombinieren (niedrige Erfolgsrate)
- Zoe: NFDI Helpdesk: Unterstützung für Förderungsanträge
- Martin: Sammlungsarbeit:
Nachhaltigkeit Sammlungsdaten häufig nur granular vorhanden
- Martin: NFDI4C: Interdisziplinärer Dialog, übergeordneter Bereich muss noch entstehen
- Zoe: Gutes Zeichen DFG hat dazu aufgerufen, Feedback aus der Wissenschaft zu erhalten für neue Förderlinie
- Maria: Was können wir als AG machen? Zoe leitet Informationen weiter, wir stellen sie auf die Website – weiterer konkreter Handlungsspielraum, was Infos zur Förderung betrifft?
- Martin: Koordinierungsstelle bietet Einzelberatung an, was Antragsstellung etc. angeht. Man kann sich jederzeit an Martin direkt oder die Koordinierungsstelle wenden. https://wissenschaftliche-sammlungen.de/de
Schluss
=
Nächste Termine:
11.08. 10:00 Uhr Lose Enden 22.09. 10:00 Uhr Makerspace Gießen ? -> Alissa fragt an 20.10. David Kühner MUT 24.11. Gyrolog(eventuell externer Termin für Gyrolog) 15.12. (offen) möglicherweise Einblick zu schneller Blenderverwendung Florian Richter
Kristall2000 IIIF? NFDI4Culture? Automatisierung?
Weitere Termine 15.-17.09. Workshop Sammlungstagung: Maria & Robert 2D & 3D Digitalisierung
Alissa: Idee: gleiches Objekt digitalisieren und dann vergleichen? Idee interessant, was ist daraus geworden? Robert: Nicht weiter geführt: Vorschlag für den August: Sammelsitzung von losen Enden?